مهم ترین خصوصیّت اخلاقی مرحوم سیدموسی زرآبادی این بودکه مردم رابه اخلاق وادب ورسیدگی به حال افتادگان توصیه می کرد. توجه ایشان به اخلاق قرآنی ورسول خدا(ص) مهم تر و بیشتر از تربیت مردم به احکام دین بود.در تربیت شاگردانش ابتدابه فکرتصفیه و تزکیۀ نفس آنهابود،سپس به فکر عرفان و جهات دیگر که مهم ترین قدم در راه عرفان می باشد. به علما و سادات احترام ویژه ای می گذاشتند. بسیار سّرپوش بودند. هرعیبی از کسی می دیدند، برای دیگران افشا نمی کردند.در حدقدرت خود،قدمشان،قدم اهل بیت (ع) بودومنش ایشان،منش اهل بیت(ع).

به نقل ازحجت الاسلام سیّدباقرمحمّدی نسب(دانای اسرار)